Facissatio quattuor amplificationis acidi nucleici pertentat ad cognoscendum SARS-CoV-2 in Aethiopia

Gratias tibi ago pro natura.com adire. Versionem navigatoris limitata CSS auxilio uteris. Ad optimam experientiam commendamus ut navigatro renovato uteris (vel inactivare Compatibilitas Modus in Penitus Rimor). Praeterea, ad sustentationem permanentem, situm sine stylis et JavaScript ostendemus.
Simul labitur carousel trium ostentat. Bullae Priore et Posteriore utere ut per tres lapsus tempore moveantur, vel globulis lapsus utere in fine, ut per tres lapsus tempore moveatur.
Cum anno MMXIX coronavirus morbo (COVID-19) ingruente, multae amplificationis acidi nuclei commerciales probationes (NAATs) circa mundum ortae sunt et vexillum pertentandi facti sunt. Etsi multae probationes cito evolutae sunt et ad laboratorium diagnostica probationes applicatae, horum probatio perficientur in variis occasus non aestimata est. Hoc igitur studium intendit aestimare Abbatis SARS-CoV-2, Daan Gene, BGI, et Sansure Biotech pertentare utens Relatio Composita Latin (CRS). Studium perductum est in Instituti Sanitatis Publicae Aethiopicae (EPHI) ab anno 1 ad 30 Decembris 2020. 164 exemplaria nasopharyngea adhibita QIAamp RNA ornamentum mini et Abbatis DNA systematis praeparationis specimen. Speciminum 164, 59.1% erant affirmativa et 40.9% negativa pro CRS. Sansure Biotech positivity was significantly low compared with CRS (p < 0.05). Sansure Biotech positivity was significantly low compared with CRS (p < 0.05). оложительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p< 0,05). Proventus Sansure Biotech positivi erant signanter inferiora cum CRS comparati (p < 0.05).CRS Sansure Biotech p <0.05）。CRS Sansure Biotech p <0.05）。 Sansure Biotech было значительно еньше положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). Sansure Biotech haud paucas eventus positivos CRS comparatos habuit (p < 0.05).Summa consensio quattuor analysuum 96.3-100% ad CRS comparata erat. Praeter condicionem humilem positivity Sansure Biotech incassum, effectus quattuor tentationum paene comparabilis erat. Quale, Sansure Biotech [Investigationis Solus (RUO)] inceptum additicium sanationis usum in Aethiopia requirit. Denique investigationes additae censendae sunt aestimare pertentationes congruis petitionibus corporis fabricatae.
Laboratorium probatio pars est Organizationis Salus Mundi (QUI) Consilium Strategic pro Coronaviro Morbus 2019 (COVID-19) Praeparatio et Responsio (SPRP). QUI monet nationes egere facultatem laboratorium aedificandi ad meliorem praeparationem, casum proprium administrationis, vigilantiae et celeri responsionis ad publicam salutem provocat. Hoc suggerit munus officinarum clavis esse ad notandum morbum et epidemiologiam emergentium infectiosorum agentium ac moderandorum eorum divulgationem.
Diagnosis COVID-19 requirit epidemiologicam et medicam informationem, indicia personalia/signa, et notitia radiographica et laboratoria. Cum tumultus COVID-19 in Wuhan, Sinis nuntiavit, multae amplificationes acidi nuclei commerciales probat (NAATs) circa mundum ortae sunt. Verus tempus e contrario transcriptio catenae reactionis polymerasis (rRT-PCR) adhibita est ut methodus exercitationis et regulae pro laboratorio diagnosi gravium syndromi respiratorii acuti 2 (SARS-CoV-2) 3 infectio. Deprehensio molcularis SARS-CoV-2 typice innititur in N (involucro interdum gene), E (gene involucro interdum), et RdRp (RNA-dependens RNA polymerasis gene) genes in ORF1a/b (ape- lectus frame 1a/b) . gene) regione quae ex genoma virali notatur. Habentur regiones principales conservatas inventas in genomatibus viralibus propter recognitionem virus. Inter haec genes, RdRp et E genes altam detectionem analyticam habent sensitivum, dum N gene analyticam sensibilitatem habet humilis.
Persecutio PCR pertentationum variari potest secundum varias causas ut: extraction reagentia, amplificatio/deprehensio reagentia, methodus extractio, qualitas machinae PCR et aliorum instrumentorum. Cum mensis Aprilis anni 2020, plus quam 48 diversae diagnosticae cogitationes ex novem terris acceperunt tumultuarios Usus LICENTIA (EUA) pro COVID-196 diagnostica. In Aethiopia plusquam XIV tempus reale PCR suggestus pro PCR detecto of SARS-CoV-2 ad 26 institutiones publicae valetudinis publicae adhibentur, inclusis ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 et quantitatis studio7. Praeterea variae PCR testi kitae praesto sunt, ut Daan Gene test, Abbott SARS-CoV-2 test, Sansure Biotech test, et SARS-CoV-2 BGI test. Etsi rRT-PCR valde sensibile est, aliqui aegroti cum COVID-19 referunt eventus negativos falsos ob insufficiens exemplaria acidum ribonucleicum viralem (RNA) in speciminibus ex impropriis collectionibus, transportandis, repositionibus et tractandis, ac probationibus laboratorium. conditiones et actiones personarum8. Praeterea, specimen vel imperium mishandling, cycli limen (Ct) occasus, et reactivitas cum aliis acida pathogenica nucleica vel iners/residua SARS-CoV-2 RNA ducere potest ad falsos eventus positivos in rRT-PCR9 pertentationes. Patet ergo quod per probationes portatores fragmentorum generum cognoscere possunt, sicut ne discernere quidem possunt inter genes virales vere activas, ita probationes non possunt nisi tabellarios cognoscere et non aegros. Ideo interest diagnostica perficientur aestimare modis in nostro occasu normas utendi. Etsi multi NAAT regentes praesto sunt apud Instituti Health Publicae Aethiopicae (EPHI) et per universam regionem, nulla tamen aestimatio eorum efficaciae comparativa nuntiata est. Hoc ergo studium intendit aestimare comparativam obeundis commercium ornamentis in promptu deprehendendis SARS-CoV-2 per rRT-PCR speciminibus clinicis adhibitis.
A summa 164 participes cum suspectis COVID-19 in hoc studio recepti sunt. Pleraque exemplaria ex centris curationis (118/164 = 72%) erant, reliqui autem 46 (28%) participes erant centris non curationum. Inter participantium centrum non tractatum, 15 (9.1%) habuit causas suspectas amet ac 31 (18.9%) contactus causarum confirmatarum habuit. Nonaginta tres (56,7%) participes fuerunt masculi, media (± SD) aetate participantium 31.10 (± 11.82) annorum.
In hoc studio, positivus et negativus quattuor experimentorum pro COVID-19 determinatae sunt. Ita, positivi rationes abbatis SARS-CoV-2 primordium, Daan Gene 2019-nCoV tentant, SARS-CoV-2 BGI tentant, et Sansure Biotech 2019-nCoV tentant 59.1%, 58.5%, 57.9% et 55.5% respective. . Compositum positivum et negativum referat vexillum (CRS) ustulo 97 (59.1%) et 67 (40,9%), respective (Tabula 1). In hoc studio definitio CRS fundata est regulae "quaelibet affirmativae", qua ex quattuor eventibus probatis, duo vel plures eventus qui eundem exitum dederunt, veri affirmativi vel negativi habiti sunt.
In hoc studio invenimus pactum recipis negativum (NPA) de 100% (95% CI 94.6-100) omnibus analysibus CRS comparatis. Analysis Sansure Biotechnologia minimam PPA 93.8% ostendit (95% CI 87.2-97.1) et Daan Gene 2019-nCoV analysin altiorem consensum 99.4% habuit (95% CI 96.6-99.9). E contra, summa concordia inter primordium SARS-CoV-2 BGI et Sansure Biotech 2019-nCoV inceptum erat 98,8% et 96,3%, respective (Tabula 2).
Cappa cohaerens Cohen pacti inter CRS et Abbatem SARS-CoV-2 primordium plene constat (K = 1.00). Similiter, kappa Cohen valores a Daan Gene 2019-nCoV deprehensis, SARS-CoV-2 BGI, et Sansure Biotech 2019-nCoV plene cohaerent etiam cum CRS (K ≥ 0.925). In hac analysi comparativa, experimentum chi-quadratum (McNemar test) ostendit Sansure Biotech 2019-nCoV eventus primordium fuisse ab eventibus CRS (p = 0.031) (Tabula II).
Ut in Fig.1 recipis pretii minimi Ct (< 20 Ct) abbatis SARS-CoV-2 primordium (compositae RdRp et N gene) 87.6% et ORF1a/b gene Ct valoris Sansure Biotech 2019-nCoV primordium ostendit recipis humilem Ct valorem (< 20 Ct) erat 50.3% et magni valoris (36–40 Ct) erat 3.2%. 1 recipis pretii minimi Ct (< 20 Ct) abbatis SARS-CoV-2 primordium (compositae RdRp et N gene) 87.6% et ORF1a/b gene Ct valoris Sansure Biotech 2019-nCoV primordium ostendit recipis humilem Ct valorem (< 20 Ct) erat 50.3% et magni valoris (36–40 Ct) erat 3.2%.Ut in Fig.1, процент наименьшего начения Ct (<20 Ct) анализа Abbatis SARS-CoV-2 (комбинированный ген RdRp и N) составил 87,6чение а на. анализа Sansure Biotech 2019-nCoV показало то процент низкого значения Ct (< 20 Ct) составлял 50,3%, а высокое начлокое начлокое 3%в. 1, recipis valoris infimi Ct (< 20 Ct) analysis abbatis SARS-CoV-2 (gene RdRp et N composita) 87.6% erat, et CT valorem ipsius ORF1a/b analysis gene Sansure Biotech 2019-nCoV demonstravit. recipis valorem vile Ct (< 20 Ct) pro 50.3%, et magni valoris Ct (36-40 Ct) pro 3.2%.1 ABBATIS SARS-CoV-2 RdRp N Ct < 20 Ct）为87.6%，Sansure Biotech 2019-nCoV ORF1a/b Ct Ct (< 20 Ct) 50.3%，高Ct (36-40 Ct) 3.2%。 Ut in Figura 1, infima Ct valorem recipis (< 20 Ct) abbatis SARS-CoV-2 testum (coniunctio gene RdRp et N) est 87.6%, ORF1a/b gene Ct valor Sansure Biotech 2019-nCoV test centesima est 50.3%, Ct (36-40 Ct) recipis 3.2% est. ак показано на рисунке 1, анализ Abbatis SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое низкое пр<20ентное на) процентное на) процентное на) ен RdRp и N) имел самое низкое пр<200. 87,6%, а начение Ct ена ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019- нализ nCoV показал низкий Ct. Ut in Figura 1, Abbatis SARS-CoV-2 primordium (coniungendo genes RdRp et N) infimum recipis Ct valorem (< 20 Ct) ad 87.6%, dum Ct valorem generum ORF1a/b in Sansure Biotech 2019 studium – Analysis nCoV humilem ostendit Ct. роцент начений (< 20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких начений Ct (36–40 Ct) составил 3,2%. Recipis valorum (< 20 Ct) erat 50.3%, et recipis valorum altorum Ct (36-40 Ct) erat 3.2%.Abbatis SARS-CoV-2 B testia scripta Ct valores supra XXX. Contra, e genere BGI SARS-CoV-2 primordium ORF1a/b gena magni pretii (> 36 Ct) erat recipis 4% (Fig. 1). Contra, e genere BGI SARS-CoV-2 primordium ORF1a/b gena magni pretii (> 36 Ct) erat recipis 4% (Fig. 1). другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ен ORF1a/b имел высокое начение Ct (> 36 Ct), процент которого составого состав. Ceterum in analysi BGI SARS-CoV-2 gene ORF1a/b magni pretii Ct (> 36 Ct), cuius recipis erat 4% (Fig. 1).BGI SARS-CoV-2 ORF1a/b Ct > 36 Ct）的百分比为4%（图1）。 Contra, in deprehensione BGI SARS-CoV-2, recipis generum ORF1a/b cum valore magni Ct (>36 Ct) est 4% (Figura 1). другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими значениями Ct (>36 Ct) составил 4% (рис. 1). Ceterum in analysi BGI SARS-CoV-2, recipis genes ORF1a/b cum valoribus altis Ct (>36 Ct) erat 4% (Fig. 1).
In hoc studio 164 exempla nasopharyngea cepimus. Omnia genera pertentationum, RNA solitudo et amplificatio fiebant utentes modos et ornamenta a singulis artifices commendata.
Hoc studium demonstratum est Abbatis probationem pro SARS-CoV-2 eandem detectionem habere quam CRS, cum 100% affirmativis, negativis et altiore concordantiae. Cohen kappa pactum est 1.00, plenam concordiam cum CRS indicans. Simile studium ab Universitate Washington in US invenit altiorem sensum et proprietatem Abbatis experimenti pro SARS-CoV-2 93% et 100% fuisse, respective ad officinam determinatam primordium (LDA) CDC comparatum. . 11. Abbatis SARS-CoV-2 detectio ratio innititur simultanea detectio generum N et RdRp, sicut utraque gena magis sensitiva, negativa falsa obscuratis. Studium Vindobonae, Austria etiam demonstravit magnas extractionis specimen volumina et detecta volumina eluentia, dilutionem effectus elevatam et deprehensionem efficientiam augendam 13 . Ita perfectum certamen Abbatis pro SARS-CoV-2 primordium coniungi potest cum systema detectionis suggesti quae simul gena combinatorialia detegit, magnum numerum exemplorum extrahit (0.5 ml), et magna copia elucet utitur (40 µl).
Eventus noster etiam ostendit detectionem testium geneticorum Daan observantiam paene similem esse ac CRS. Hoc consentaneum est cum studio 14 in Universitate Anhui in Huainan, China, et affirmationem 100% affirmativam pacti fabricantis. Quamvis relationes de congruentibus eventibus, unum specimen negativum falsum postquam idem elusit testimonium, sed in Abbate SARS-CoV-2 et Sansure Biotech nCoV-2019 pertentavit affirmativa fuisse. Hoc suggerit variabilitas esse in eventibus per varias tentationum rationes. Nihilominus in studio peracto in China15, eventus Daan Gene primordium significanter diversus est (p < 0.05) comparatus ad eorum relationem lab-definitam primordium. Nihilominus in studio peracto in China15, eventus Daan Gene primordium significanter diversus est (p < 0.05) comparatus ad eorum relationem lab-definitam primordium. ем не енее, в исследовании, проведенном в итае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p. лабораторного талонного анализа. Nihilominus in investigatione in China15 analysi Daan Gene eventum significanter diversum (p < 0.05) ab analysi laboratorio referente.15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异（p < 0.05）。15，大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差 <0.05 днако в исследовании, проведенном в итае15, результаты генетического теста Daan начительплисль (p. сравнению с его эталонным лабораторным тестом. Tamen in investigatione in China15, eventus geneticae probationis Daan significanter diversi sunt (p < 0.05) comparati ad relationem testam officinarum.Discrepantia haec potest ob sensibilitatem relationis test deprehendendi SARS-CoV-2, et studia ulteriora magni momenti esse possunt ad causam definiendam.
Praeterea studium nostrum comparativum de SARS-CoV-2 BGI perpensum cum CRS temptaturum, optimum positivum recipis pactum (PPA = 97.9%), negativum recipis pactum (NPA = 100%), et altiore quotus pacto consensum per sexum. OPA). ). = 98.8%). Cohen Kappa valores bonorum consensum ostendit (K = 0,975). Studia in Nederlandia 16 et China15 constantes eventus ostenderunt. Testium SARS-CoV-2 BGI una est gene (ORF1a/b) detectio test utens 10 µl amplificationis/deprehensio eluet. Quamvis bonum statisticum consensum cum nostro referentiis eventibus, analysis duo exempla positiva desiderari (1.22%) totius exempli. Hoc ingentes implicationes orci habere potest pro dynamicis transmissionibus tam patientis quam communitatis.
Alia analysis comparativa in hoc studio inclusa fuit Sansure Biotech nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) primordium; altiore par recipis erat 96.3%. Robur pacti etiam a Cohen Kappa valorem determinatum, qui erat 0,925, plenam consensum cum CRS significans. Item eventus nostri idem sunt studiis in Central Australi Universitate in Changsha, Sinis, et in Clinica Laboratorium Department of Liuzhou Hospitalis Populi, Liuzhou urbem, China17. Etsi superius bonum concordantiae statisticalis commemorabatur, chi-quadratus experimentum (MacNemar test) ostendit exitum Sansure Biotech inceptum habuisse peraeque differentiam significantem cum CRS comparatam (p < 0.005). Etsi superius bonum concordantiae statisticalis commemorabatur, chi-quadratus experimentum (MacNemar test) ostendit exitum Sansure Biotech inceptum habuisse peraeque differentiam significantem cum CRS comparatam (p < 0.005). есмотря на то, что ло афиксировано указанное выше орошее статистическое соответствие, (критекрий критекрий критекрий ороее статистическое Макнемара) показал, чттзультат Анализа Sansure Biotech имеет Статистически чзнавнию С CRS (P <0,005). Etsi bonum pactum statisticum supra relatum est, chi-quadratum experimentum (McNemar test) ostendit exitum Sansure Biotech inceptum habuisse peraeque differentiam significantem cum CRS comparatam (p < 0.005).MacNemar Sansure Biotech CRS p <0.005）。尽管 记录 了 上述 良好 统计 一致性, 但 检验 ((Macnemar 检验 表明 ,, Sansure Biotech 检测 结果 与 CRS 相比 具有 显着 ((P <0.005 ................ . есмотря на отмеченное выше орошее статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерийа) пакнерий акнерий акнерий акнерий акнери статистически начимую разницу (p< 0,005) между анализом Sansure Biotech и CRS. Quamvis bonum statisticum consensum supra notatum, chi-quadratum experimentum (McNemar test) peraeque notabilem differentiam (p < 0.005) ostendit inter Sansure Biotech primordium et CRS.Sex exempla (3.66%) inventa sunt falsa negativa cum CRS comparata (Supplementary Table I); hoc magni momenti est, praesertim dynamica vis transmissionis viri. Praedicta notitia etiam hanc deprehensionem humilem rate15 sustinet.
In hoc studio, Ct valores pro singulis suggestu et respectivis determinatis, cum vilissimo Ct valore in Abbate SARS-CoV-2 primordium relatum est. Hoc eventum referri potest cum Abbate simultaneo coniuncto systematis experimenti geneticae de SARS-CoV-2 detectione. Itaque, secundum figuram 1, 87.6% abbatis SARS-CoV-2 eventus habuit Ct valores infra 20. Pauci tantum numeri effectorum exemplarium (12.4%) erant in 20-30 parte. Ct valores supra 30 non scripti sunt. Praeter Abbatem usum tabulae geneticae probati formarum SARS-CoV-2, hic eventus ad deprehendendum limitem inferiorem referri potest (32.5 RNA/mL)18, qui ter minor est quam limitatio 100 RNA exemplarium societatis inferioris. /mL. ml)19.
Studium hoc nonnullas limitationes habet: primum modos regulae/references non habemus [sicut onus virale vel alia probata laboratoria (LDA)] propter indigentiam facultatum. Secundo, omnia specimina in hoc studio adhibenda erant swabs nasopharyngea, cum eventus non ad alia genera speciminis applicata essent, et tertia nostra magnitudine exempli parva erat.
Hoc studium perficiendum quattuor rRT-PCR pertentat ad SARS-CoV-2 usus exemplaria nasopharyngea. Omnis deprehensio pertentat paene similem effectum habuit, excepto Sansure Biotech. Praeterea, humilis positio rate notata est in Sansure Biotech primordium comparatum cum CRS (p < 0.05). Praeterea, humilis positio rate notata est in Sansure Biotech primordium comparatum cum CRS (p < 0.05). роме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). Praeterea Sansure Biotech test ostendit humilem recipis proventus positivos CRS comparatos (p < 0.05).CRS Sansure Biotech (p <0.05)。CRS Sansure Biotech (p <0.05)。 роме того, анализ Sansure Biotech имел более низкий уровень положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). Praeterea Sansure Biotech primordium habuit ratem positivitatis inferioris comparatus CRS (p < 0.05).Sansure Biotech nCoV-2019 (RUO) analysis PPA, NPA et altiore consensu 93,5% exceditur cum vi consensus valoris 0,925. Denique Sansure Biotech Assay (RUO) ulteriore sanatione usus in Aethiopia eget, et investigationes additae aestimandae postulationes a singulis artifices censendae sunt.
Consilium comparativum perductus est ad quattuor facultates sanitatis in Addis Ababa, Eka Kotebe Hospitalis, Curatio Centre Ecclesiae Millennium, Zewooditu Hospitalis Memorialis, et Hospitalis Sancti Petri Tuberculosis Specialista. Data inter Decembrem 1 et 31 2020 collecta sunt. Facultates medicinae huius studii ex proposito electi sunt secundum summum numerum casuum et promptitudinis curationis maioris in urbe. Similiter instrumenta, inclusa ABI 7500 et abbatum m2000 per tempus realium PCR instrumentorum, secundum commendationem NAAT fabricantium gerentis delecti sunt, et quattuor ornamenta PCR deprehensionis ad hoc studium delectata sunt, ut pleraque in Aethiopia laborantibus saltem saltem adhibitis. ex iis quatuor. Gene test, Abbott SARS-CoV-2 test, Sansure Biotech test, et SARS-CoV-2 BGI probatio in studio peracta).
Testis pro SARS-CoV-2 fiebat ab 1 ad 30 Decembris 2020 utens 3 ml Transport Medii (VTM) (Miraclean Technologia, Shenzhen, China) a singulis per inquisitionem pro COVID-19 relata ad EPHI. Specimina nasopharyngealia a collectoribus formatis collecta et in triplo sarcinas ad EPHI missa sunt. Prius quam acidi nucleici solitudo, unumquodque specimen identificatio numerus assignatur. Extractio fit ab unoquoque sample statim in adventu utendi modi extractionis manualis et automatice. Ita, pro extractione automatis abbatis m2000, 1.3 ml (inclusa 0,8 ml volumen mortuum et 0.5 ml extractionis voluminis inleti) specimen ex utroque specimen extractum et per Abbatem DNA Sample Praeparationis Systematum (Abbott Molecular Inc. des Plaines, etc. IL, USA). ) praepostere 96 [92 exempla, duo deprehensio moderatorum ac duarum non-temptatum (NTC)] in altiore processu (retrieval et deprehensio) duorum circumeuntium SARS-CoV-2 (EUA) in tempore reali comprehensa est. fodienda. Similiter ad extractionem manualem, iisdem exemplis utuntur (pro extractione automata et inventione). Ita, per processum, 140 µl exempla aliquota et extracta sunt utens QIAamp Viral RNA Mini Kit (QIAGEN GmbH, Hilden, Germania) in batches 24 (inclusa 20 exemplaria, duo primordium controllata et duo NTCs) super novem orbes. Manually eluates extracti ampliati et detecti sunt utentes ABI 7500 scelerisque cycli SARS-CoV-2 BGI utentes, Daan Gene primordium, et Sansure Biotech.
Solitudo et purgatio automated SARS-CoV-2 viralis RNA sequitur principium magneticum utens regentibus specimen praebendi ab abbate DNA. Inactivatio exemplorum et solutionis particularum viralium exercetur utens purgat guanidinem isothiocyanatum continens ad denaturam interdum et inactivate RNase. RNA tunc separatus est a interdum a solida periodo separationis utens silica, id est guanidinium salis et alkalini pH Lysis quiddam promovens ligaturam acidorum nucleicorum ad silicam (SiO2). Gradus lotis reliquos servo et strages removet ad solutionem claram producendam. Transparens RNA separatim a microparticulis silica fundatis utens instrumenti agri magnetici 20,21. Contra, manualis solitudo et purificatio RNA per modum columnae spins utendi loco centrifugationis magneticae stantis et microparticulorum ab eluent separatione.
Abbas Real-Time SARS-CoV-2 Detection Test (Abbott Molecular, Inc.) fiebat secundum mandatum fabrica, quod EUA19,22 ab QUI et FDA accepit. In hoc protocollo, specimen inactivationis ante extractionem fiebat in balneis aquae 56 °C pro 30 min. Post virus inactivationis, extractio acidi nucleici fiebat in instrumento bbatis m2000 SP ab 0,5 ml VTM utens ratio praeparationis exempli m2000 DNA. iuxta fabricam. Amplificatio et detectio fiebant instrumenti RT-PCR Abbatis m2000, et detectio dualis facta est pro gene RdRp et N. ROX) et VIC P (proprietatis fucus) ad nisum et detectionem moderatorum internorum, permittens simultaneum detectionem utriusque productorum amplificationis 19 .
Modus deprehensionis amplificationis huius ornamenti in uno gradu RT-PCR technologiae fundatur. ORF1a/b et N genes delectae sunt regiones conservatae a Daan Gene Technologiae ad ampliationem regionis scopum deprehendendas. Specificae primariorum et fluorescentium speculatoriarum (speculae N gene cum FAM, ORF1a/b intitulatae cum VIC explorantur) designatae sunt ad deprehendendas SARS-CoV-2 RNA in speciminibus. Postrema enucleata et magisteria mixta parata sunt addendo 5 µl eluentis ad 20 µl magistri miscent ultimo volumine 25 µl. Ampliatio et detectio eodem tempore facta sunt in instrumento reali PCR ABI 750024.
ORF1a/b et N genes deprehensi sunt usura Sansure Biotech nCoV-2019 Acidum Nucleicum Diagnostic Ornamentum (fluorescens PCR detectio). Praeparate speciosissimas speculatorias pro singulis gene scopis eligendo alveum FAM pro regione ORF1a/b et canalem ROX pro N gene. Huic deca- mento ornamentum, reagentes ac disertissimum dominum miscent hoc modo: para 30 µl dominum miscere gerentem et 20 µl specimen detectionis/amplificationis elusum. Real-time PCR ABI 750025 ad amplificationem / deprehensio adhibebatur.
SARS-CoV-2 BGI test est fluorescens reale tempus rRT-PCR ornamentum diagnosis COVID-19. Scopus regionis in ORF1a/b regione genome-SARS-CoV-2 sita est, quae una methodus deprehendendi gene est. Praeterea, gene custodia β-actin humana est scopo gene intus regulari. Magister miscere paratur miscere 20 µl magistri miscere reagentem et 10 µl extracti RNA specimen in lamella putea. ABI 7500 Fluorescens quantitatis real-time PCR instrumentum ad amplificationem et detectionem adhibitum est. Omnes amplificationis acidi nucleici, PCR condiciones pro singulis decursibus discurrentes, et eventus interpretatio secundum mandata cuiusque corporis fabrica facta sunt (Tabula III).
In hac analysi comparativa, methodum referentem normae non adhibemus ad determinandam cento consensum (positivum, negativum et universale) et alios parametri comparationis pro quattuor analysibus. Unaquaeque examinis comparatio cum CRS facta est, in hoc studio regulam "aliquam positivam" ponebat CRS, et eventus definitus, non uno experimento, saltem duos eventus experimentorum pares usi sumus. Praeterea, in casu translationis COVID-19, falsae eventus negativi periculosiores sunt quam eventus positivi falsi. Dicere ergo "positivum" quam accuratissime ex eventu CRS, saltem duo tentamenta affirmativa esse oportet, id quod saltem unum positivum eventum ab EUA primordium provenire verisimile est. Ita ex quattuor probatis eventibus, duo vel plures eventus qui eundem exitum praebent considerantur veri affirmativi vel negativi 18,27.
Data colligebantur utentes formas extractionis structuris datas, ingressu et analysi data fiebant utens programmata Excel statistica et SPSS versio 23.0 pro statisticis descriptivis. Expositae sunt affirmativae, negativae et altiore centesimis consensus, et usus est Kappa ad modum pacti cuiusque methodi cum CRS determinare. Valores Kappa sic interpretantur: 0.01 ad 0.20 pro leni conventione, 0.21 ad 0.40 pro conventione generali, 0.41-0.60 pro modica concordia, 0.61-0.80 pro maiori concordia et 0.81-0.99 pro plena conventione 28. .
Ethica purgatio ex Universitate Addis Ababa obtenta est et omnia protocolla experimentalia huius studii ab Aethiopico Publica Valetudinis Instituti Scientific Ethica Recensione approbata sunt. EPHI/IRB-279-2020. Omnes methodi adhibitae sunt secundum monita et praescripta Nationalis Aethiopicae Comprehensiva Guidelines pro tractatu COVID-19. Insuper consensus scriptorum conscius ab omnibus studiis participantium adeptus est ante participationem studii.
Omnia data in hoc studio consecuta vel enucleata in hoc articulo edito comprehenduntur. Data subsidia huius studii eventus ab respectivis auctoribus rationabili requisitione praesto sunt.
Ordo Mundi Sanitarius. Recommendations for Laboratory Testing Strategies for COVID-19: Interim Guidance, March 21, 2020 No. WHO/2019-nCoV/lab_testing/2200.1 (WHO, 2020).
Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 callidi diagnosis in Department: All-in in Usu. Mouliou, DS, Pantazopoulos, I. & Gourgoulianis, KI COVID-19 callidi diagnosis in Department: All-in in Usu.Muliou, DS, Pantazopoulos, I. et Gurgulianis, KI Intelligent diagnosis de COVID-19 in genere subitis: omnia in usu.Muliou DS, Pantazopoulos I. et Gurgulyanis KI diagnosis intelligentis de COVID-19 in subitis Dicasteriis: finis-ad-finem integrationem in praxi. R. P. Respire. medicamentum. 3, 263-272 (2022).
Mitchell, SL & St George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay. Mitchell, SL & St George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA assay.Mitchell, SL, George, K. Evaluation of the COVID19 ID NOW EUA tentation.Mitchell SL et S. George K. Aestimatio COVID19 ID NUNC EUA intenta est. J. Fuscus. Virus. 128, 104429. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104429 (2020).
OMS. Laboratorium deprehensio coronavirus morbo 2019 (COVID-19) in suspecto morbo humano. https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501 (accessed 15 Augusti 2020) (WHO, 2020).
Udugama, B. et al. COVID-19 Diagnosis: Morbi et Instrumenti Test. ACS Nano 14 (4), 3822–3835 (2020).
Syed S. et al. Instauratio Collegii Pathologorum Orientalis, Mediae et Africae Australis — Scholae Regionalis Pathologiae Mediae Orientalis et Africae Meridionalis. Africam. J. Lab. medicamentum. 9 (1), 1-8 (2020).
Aethiopicum Institutum Salutem Publicam, Ministerium Foederatum Health. Interim National Strategy et Guidance pro Laboratory Diagnosis COVID-19. https://ephi.gov.et/images/novel_coronavirus/EPHI, 2020) (EPHI, 2020).
Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Falsae negativae probationes pro SARS-CoV-2 contagione provocationes et implicationes. Woloshin, S., Patel, N. & Kesselheim, AS Falsae negativae probationes pro SARS-CoV-2 contagione provocationes et implicationes.Voloshin S., Patel N. et Kesselheim AS falsum-negativum probationes pro SARS-CoV-2 contagionibus earumque consequentibus.Voloshin S., Patel N. et Kesselheim AS probationes falsae-negativae ad provocationem et labem SARS-CoV-2 contagionis. N. lat. J. Medicina. 383 (6), e38 (2020).
Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI casus falsus-positivus et negativus COVID-19 falsus: Praeventionis respiratorii et administratio strategies, vaccinatio et prospectus ulteriores. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI casus falsus-positivus et negativus COVID-19 falsus: Praeventionis respiratorii et administratio strategies, vaccinatio et prospectus ulteriores. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI ожноположительные и ложноотрицательные случаи COVID-19: респираторная профилактика и лактика и лактика вакцинация и дальнейшие перспективы. Mouliou, DS & Gourgoulianis, KI Falsae affirmativae et falsae casus negativae COVID-19: praeventionis respiratoriae et curationes strategies, vaccinationem et viam deinceps.Muliu, DS et Gurgulianis, KI casus falsus-positivus et negativus COVID-19: consilia respiratoriae praeventionis et curationis, vaccinationis et itineris. R. P. Respire. medicamentum. 15 (8), 993–1002 (2021).
Mouliou, DS, Ioannis, P. & Constantinos, G. COVID-19 diagnosis in subitis department: Videns lignum sed amittens silvam. Mouliou, DS, Ioannis, P. & Constantinos, G. COVID-19 diagnosis in subitis department: Videns lignum sed amittens silvam.Mouliou, DS, Ioannis, P. et Constantini, G. COVID-19 Diagnosis in Department: Vide Lignum, Lose Forestam.Muliou DS, Ioannis P., et Constantinus G. COVID-19 Diagnosis in conclavia incerta: Non satis silvae arboribus. Apparere. medicamentum. J. https://doi.org/10.1136/emermed-2021-212219 (2022).
Degli-Angeli, E. et al. Validation and Validation of the Analytical and Clinical Performance of the Abbott RealTime SARS-CoV-2 Asssay. J. Fuscus. Virus. 129, 104474. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104474 (2020).
Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatooniana, B. Comparatio quinque primariorum e regione genomae diversae COVID-19 ad detectionem virus infectio a conventionali RT-PCR. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatooniana, B. Comparatio quinque primitivarum ponit e diversis regionibus genomatis COVID-19 ad detectionem virus infectionis a conventionali RT-PCR.Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. et Aflatunyan, B. Comparatio quinque numerorum primariorum e diversis regionibus genomatis COVID-19 ad detectionem infectionis viralis per conventionalem RT-PCR. Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatoonian, B. COVID-19 不同基因组区域的五个引物组，用于通过常规RT-PCR Mollaei, HR, Afshar, AA, Kalantar-Neyestanaki, D., Fazlalipour, M. & Aflatooniana, B. Comparatio 5 regionum geneticae geneticae CVID-19 ad detectionem contagionis viralis a conventionali RT-PCR.Mollaei HR, Afshar AA, Kalantar-Neyestanaki D, Fazlalipour M. et Aflatunyan B. Comparatio quinque numerorum primariorum e diversis regionibus genomatis covidorum 19 ad detectionem contagionis viralis a conventionali RT-PCR.Iran. J. Microbiology. 12 (3), 185 (2020).
Goertzer, I. et al. Praeliminares eventus nationalis externae qualitatis taxationis programmatis ad sequentia genome deprehensio SARS-CoV-2. J. Fuscus. Virus. 129, 104537. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2020.104537 (2020).
Wang, M. et al. Analytica Evaluatio efficaciae Quinque RT-PCR Kits pro Severo Acuto Respiratorio Syndrome Coronavirus 2. J. Fuscus. officinam. culus. 35(1), e23643 (2021).
Wang B. et al. Aestimatio septem commercii in promptu SARS-CoV-2 RNA detectionis kits in Sinis fundata in catena reali temporis polymerasi reactionis (PCR). orci. Chemical. officinam. medicamentum. 58(9), e 149-e153 (2020).
van Casteren, PB et al. Comparatio septem mercatorum RT-PCR COVID-19 diagnostica kitarum. J. Fuscus. Virus. 128, 104412 (2020).
Lu, Yu, et al. Comparatio diagnostica perficiendi duorum PCR kitum ad detectionem acida nucleica SARS-CoV-2a. J. Fuscus. officinam. culus. 34(10), e23554 (2020).
Lefart, PR, etc. Comparativum studium quattuor SARS-CoV-2 amplificationis acidi nucleici probandi suggesta (NAAT) demonstravit id nunc effectum esse signanter degradatum secundum genus patientis et exempli. diagnosis. microbiologiae. Inficere. diss. 99 (1), 115200 (2021).
Abbatis moleculae. Abbatis realis-temporis Sars-CoV-2 involucrum analyseos insertum est. https://www.molecular.abbott/us/en/products/infectious-disease/RealTime-SARS-CoV-2-Assay. 1-12. (ut die 10 Augusti 2020) (2020).
Klein, S. et al. SARS-CoV-2 RNA separatim utens globulis magneticis per RT-qPCR et RT-LAMP deprehensio magnarum celeritatum. Vitus 12 (8), 863 (2020).